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【R】遺伝子IDおよび遺伝子シンボルの相互変換【biomaRt】

遺伝子名のフォーマットはEnsemblやUniProt等のデータベース毎に異なります。例えばARF5は遺伝子シンボルと呼ばれるフォーマットですが、この遺伝子のEnsemblにおける名称はENSP00000000233、UniProt ID...
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【STRING】Pathway一覧と構成タンパクの取得【Reactome】

Pathwayとは、解凍系のような細胞の中で起きる連鎖的な化学反応のことです。 サンプル間のトランスクリプトームやプロテオームにおいて有意に変動した遺伝子群が似ていても、Pathwayの観点では似ていないことがあります。 その...
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