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やってみた

【血圧予測#3】Polar OH1の心拍データをリアルタイムで取得【MacOS】

心拍は血流速度です。従って、その時間変化は本質的に血圧の情報を含んでいます。そこで、2点間の心拍から血圧を予測することに挑戦してみます。 前回までには、心拍計の選定と心拍数を取得するために必要なラズベリーパイの準備の手順を紹介しまし...
備忘録

【Python/Pandas】書式設定を制御してExcelに出力【StyleFrame】

本記事では、PythonのライブラリであるpandasからExcelファイルへ出力する際に、セル内改行や行または列の幅などを指定して出力する方法について説明します。 1. StyleFrameの準備 StyleFrameという...
備忘録

【Python】デコレータ【時間計測・Try】

本記事では、Pythonのデコレータ(関数の上の行に付与する@から始まる文言)の使用方法について、関数の時間計測やTry構文を例に説明します。 1. 時間計測 デコレータは@hogeのように宣言された下の行から始まる関数を引数...
備忘録

【Python】化合物名からIUPAC名・InChIKey・CAS番号を取得【pubchempy】

本記事では、alanineのような化合物名からIUPAC名などの他の情報を取得する方法を説明します。 具体的には以下の内容の取得について取り扱います。 synonyms:別名 CID InChI InChI...
備忘録

【Python】混合ガウス分布【scikit-learn】

1. 理論 2. 学習 2.1. 基本 モデルを宣言し、fitでデータを当てはめます。 当てはめた後のオブジェクト(gmm)が学習後のモデルです。 means_メソッドやbicメソッド、predict...
備忘録

【Python】Fisherの正確確率検定【scipy】

1. 理論 例として、全タンパクを化合物 $i$の標的であるかという観点、Pathway $j$の構成タンパクであるという観点から以下のような分割表を作成することを考えます。 全タンパク ($N$)化合物 $i$ に合計含まれ...
備忘録

【備忘録】PythonのSympyで(n元連立)(m次)方程式を解く【代数】

Sympyを用いると方程式を代数的に解いてくれます。 本記事では 2元連立1次方程式 10元連立1次方程式 2次方程式(実数解) 2次方程式(複素数解) を例に挙げて Sympy の使い方をメモしま...
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