遺伝子制御ネットワーク解析

マルチオミクスのデータを用いることで、サンプルに含まれる細胞群を代表したバーチャル細胞を構築することが可能です。バーチャル細胞は細胞の状態の時間変化をシミュレーションできる予測モデルです。

バーチャル細胞の構築には数千〜数万のマルチオミクスデータが必要であるため、現在の主たるバーチャル細胞の構築は細胞の数だけデータが得られる1細胞マルチオミクスを用いて行われています。

本記事では、1細胞マルチオームの基本的な解析とバーチャル細胞の構築方法を説明します。

1. はじめに

本記事は、以下の続きです。

深層学習を用いたバーチャル細胞の作成

マルチオミクスのデータを用いることで、サンプルに含まれる細胞群を代表したバーチャル細胞を構築することが可能です。バーチャル細胞は細胞の状態の時間変化をシミュレーションできる予測モデルです。バーチャル細胞の構築には数千〜数万のマルチ...

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2025.04.25

本記事ではRNA-SeqおよびATAC-Seqなどのマルチオミクスのデータを用いて遺伝子発現ネットワークを構築する方法を説明します。

2. 目次

• ネットワーク図を描画する方法。
• LASSOで決定した制御ネットワークをネットワーク図で可視化する。
• GitHubにInteractiveな図をUploadする。
• 結合する転写因子を記入したLINCプロットの作成。