複数の1細胞マルチオミクスデータの統合

マルチオミクスのデータを用いることで、サンプルに含まれる細胞群を代表したバーチャル細胞を構築することが可能です。バーチャル細胞は細胞の状態の時間変化をシミュレーションできる予測モデルです。

バーチャル細胞の構築には数千〜数万のマルチオミクスデータが必要であるため、現在の主たるバーチャル細胞の構築は細胞の数だけデータが得られる1細胞マルチオミクスを用いて行われています。

本記事では、1細胞マルチオームの基本的な解析とバーチャル細胞の構築方法を説明します。

1. はじめに

本記事は、以下の続きです。

STREAMを用いた解析

マルチオミクスのデータを用いることで、サンプルに含まれる細胞群を代表したバーチャル細胞を構築することが可能です。バーチャル細胞は細胞の状態の時間変化をシミュレーションできる予測モデルです。バーチャル細胞の構築には数千〜数万のマルチ...

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2025.04.22

本記事では複数の1細胞オミクスデータを統合して解析する方法について説明します。

2. 目次

• Cell Rangerを用いた統合。
• Monocle3を用いた統合 (バッチ正規化)。
• RECODEを用いたノイズ除去。
• 統合データを用いて次元削減など各種可視化を実施。
• Origin Plotの作成。