マルチオミクスのデータを用いることで、サンプルに含まれる細胞群を代表したバーチャル細胞を構築することが可能です。バーチャル細胞は細胞の状態の時間変化をシミュレーションできる予測モデルです。
バーチャル細胞の構築には数千〜数万のマルチオミクスデータが必要であるため、現在の主たるバーチャル細胞の構築は細胞の数だけデータが得られる1細胞マルチオミクスを用いて行われています。
本記事では、1細胞マルチオームの基本的な解析とバーチャル細胞の構築方法を説明します。
1. はじめに
本記事は、以下の続きです。
本記事ではバーチャル細胞を用いてダイレクトリプログラミングに必要な転写因子の組み合わせを予測する方法について説明します。
2. 目次
- ダイレクトリプログラミングに操作が必要な転写因子の導出。
- 時間に伴って変化する遺伝子のプロット。
- Optimal Transportを利用した長いスパンの時間変化予測。
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