日向ねこ

備忘録

【Python】Fisherの正確確率検定【scipy】

1. 理論 例として、全タンパクを化合物 $i$の標的であるかという観点、Pathway $j$の構成タンパクであるという観点から以下のような分割表を作成することを考えます。 全タンパク ($N$)化合物 $i$ に合計含まれ...
pandas

【R】遺伝子IDおよび遺伝子シンボルの相互変換【biomaRt】

遺伝子名のフォーマットはEnsemblやUniProt等のデータベース毎に異なります。例えばARF5は遺伝子シンボルと呼ばれるフォーマットですが、この遺伝子のEnsemblにおける名称はENSP00000000233、UniProt ID...
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