生命科学

エレクトロポレーション法（Electroporation）は、外部から電気パルスを加えることで細胞膜に微小な孔を開け、DNAやRNAといった大分子を細胞の内部へ導入する手法の一つです。もともとは遺伝子導入のために開発された技術で、遺伝子改変...

リポフェクション法とは、遺伝子の導入手法の一つで、リポソームを使用し、細胞にDNAを送り込む方法を指します。原理リポフェクション法の原理は、DNA分子とリポソームが複合体を形成することによりDNAが細胞膜を透過しやすくなる、というものです。...

ストレプトマイシンは、抗生物質の一種であり、特に結核菌に対して効果を発揮します。化学式は$\text{C}_{21}\text{H}_{39}\text{N}_{7}\text{O}_{12}$であり、その構造は1つのグルコース環、1つのス...

アンピシリンは、化学式$\text{C}_{16}\text{H}_{19}\text{N}_{3}\text{O}_{4}\text{S}$を持つ半合成型の広義スペクトルペニシリン系抗生物質です。アミノペニシリンの1つであり、グラム陽性菌...

薬剤耐性遺伝子とは、特定の抗生物質などの薬剤に対する耐性の原因となる遺伝子のことを指します。これらの遺伝子は、生物が薬剤の存在下で生存する能力を得るために進化的に取得したものであり、主に細菌などの微生物に見られます。メカニズムこれらの耐性遺...

概要全ゲノムショットガン法(Whole Genome Shotgun Sequencing: WGS)は、ゲノム全体を無作為に切断し、それぞれの断片の塩基配列を解読し、最終的に全体の塩基配列を決定する方法です。WGSの手法は、初めてゲノムシ...

概要階層化ショットガン法（Hierarchical Shotgun Sequencing）は、ゲノムシーケンシングの方法の一つであり、全ゲノムショットガン法と比較されます。本方法は、１つのゲノムを複数の小さな断片（コンティグ）に分割し、それ...

アセンブリとは、次世代シーケンサ(NGS: Next Generation Sequencer)から得られた短い配列データを元に、ゲノムの元の配列を再構築する手法のことを指します。原理次世代シーケンサは長いDNAを大量の短い断片に分割し、そ...

マッピングは、シーケンサから出力されたDNA塩基配列がゲノムのどの部位から由来しているかを同定する過程で、組み立てやアラインメントとも呼ばれます。本稿では、RNA-seqに焦点を当て、Bowtie2, BWA, STAR, HISAT2とい...

リシークエンシング（Resequencing）は、既知の配列（リファレンス配列）を基にして、対象となるゲノムの配列を決定する方法を指します。具体的には、リファレンス配列としてヒトゲノム等の既存の配列情報を利用し、その配列とターゲットとなるゲ...