備忘録 【備忘録】PythonのSympyで(n元連立)(m次)方程式を解く【代数】 Sympyを用いると方程式を代数的に解いてくれます。 本記事では 2元連立1次方程式 10元連立1次方程式 2次方程式(実数解) 2次方程式(複素数解) を例に挙げて Sympy の使い方をメモしま... 2024.05.01 備忘録
RNA-Seq 【備忘録】RNA-Seqの解析パイプライン【ペアエンド】 ペアエンド の RNA-Seq データ解析のパイプラインをメモします。 はじめに Linux OS 上で Shellscript を用いて各種NGS解析ツールを走らせて解析をします。解析内容は以下です。 md5sumに... 2024.04.30 RNA-Seq備忘録生命情報科学発現差解析
RNA-Seq 【備忘録】RNA-Seqの解析パイプライン【シングルエンド】 Single End の RNA-Seq データ解析のパイプラインをメモします。 はじめに Linux OS 上で Shellscript を用いて各種NGS解析ツールを走らせて解析をします。解析内容は以下です。 md... 2024.04.30 RNA-Seq備忘録生命情報科学発現差解析
RNA-Seq 【備忘録】HISAT2の準備【RNA-Seq】 RNA-Seqデータ解析などで用いる HISAT2 のインストール方法と使い方についてメモします。 ダウンロード こちらから「Binaries」の「Version: HISAT2 2.2.1」をクリックし、「Version: ... 2024.04.30 RNA-Seq備忘録生命情報科学発現差解析
RNA-Seq 【備忘録】Trimmomaticの準備【RNA-Seq】 SNP calling や RNA-Seqデータ解析などで用いる Trimmomatic のインストール方法と使い方についてメモします。 はじめに Trimmomatic は Java で書かれているアダプタートリミング/クオ... 2024.04.29 RNA-Seq備忘録生命情報科学発現差解析
備忘録 【備忘録】PythonのBokehでBandのグラフを描く【可視化】 サムネのようなグラフの描き方を記しておきます。PythonのBokehを用います。 Bokehのインストール Bokehを用いるので、下記等でBokehをインストールしておきます。 pip install bokeh ... 2024.04.12 備忘録