備忘録 【備忘録】PythonのSympyで(n元連立)(m次)方程式を解く【代数】
Sympyを用いると方程式を代数的に解いてくれます。本記事では2元連立1次方程式10元連立1次方程式2次方程式(実数解)2次方程式(複素数解)を例に挙げて Sympy の使い方をメモします。SympyのインストールSympyを用いるので、下...
備忘録
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RNA-Seq 【備忘録】RNA-Seqの解析パイプライン【ペアエンド】
ペアエンド の RNA-Seq データ解析のパイプラインをメモします。はじめにLinux OS 上で Shellscript を用いて各種NGS解析ツールを走らせて解析をします。解析内容は以下です。md5sumによるデータの確認Trimmo...
RNA-Seq 【備忘録】RNA-Seqの解析パイプライン【シングルエンド】
Single End の RNA-Seq データ解析のパイプラインをメモします。はじめにLinux OS 上で Shellscript を用いて各種NGS解析ツールを走らせて解析をします。解析内容は以下です。md5sumによるデータの確認T...
RNA-Seq 【備忘録】HISAT2の準備【RNA-Seq】
RNA-Seqデータ解析などで用いる HISAT2 のインストール方法と使い方についてメモします。ダウンロードこちらから「Binaries」の「Version: HISAT2 2.2.1」をクリックし、「Version: HISAT2 2....
RNA-Seq 【備忘録】Trimmomaticの準備【RNA-Seq】
SNP calling や RNA-Seqデータ解析などで用いる Trimmomatic のインストール方法と使い方についてメモします。はじめにTrimmomatic は Java で書かれているアダプタートリミング/クオリティチェックのツ...
備忘録 【備忘録】PythonのBokehでBandのグラフを描く【可視化】
サムネのようなグラフの描き方を記しておきます。PythonのBokehを用います。BokehのインストールBokehを用いるので、下記等でBokehをインストールしておきます。pip install bokehライブラリBokehのうち、以...