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【STRING】Pathway一覧と構成タンパクの取得【Reactome】

Pathwayとは、解凍系のような細胞の中で起きる連鎖的な化学反応のことです。 サンプル間のトランスクリプトームやプロテオームにおいて有意に変動した遺伝子群が似ていても、Pathwayの観点では似ていないことがあります。 その...
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【ChEMBL】化合物の標的タンパクを調べる

本記事では化合物の標的タンパクをChEMBLから取得する手順を説明します。 1. ChEMBLについて ChEMBLは欧州分子生物学研究所(EMBL)のバイオインフォマティクス研究所(EBI)が運営する医薬品などの化合物に関す...
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