1細胞マルチオーム法 1細胞マルチオームの実験と得られるデータ形式
細胞は遺伝子発現（トランスクリプトーム）だけでなく、その制御要素である染色体のオープン状態（ATAC-seq）にもとづいて理解する必要があります。10X GenomicsのChromium Next GEM Single Cell Mult...
研究
1細胞マルチオーム法 
研究 精神疾患・発達障害
今後主たるUnmet Medical Needsになると予想される精神神経疾患に関する指標をマルチオミクス・臨床検査値から推定するプログラムを作成します。特にうつ・双極性障害・統合失調症・ADHD・ASDを対象に、遺伝統計学に基づいた遺伝的...
1細胞マルチオーム法 1細胞マルチオミクスの解析とバーチャル細胞の構築
マルチオミクスのデータを用いることで、サンプルに含まれる細胞群を代表したバーチャル細胞を構築することが可能です。バーチャル細胞は細胞の状態の時間変化をシミュレーションできる予測モデルです。ただし、バーチャル細胞の構築には数千〜数万のマルチオ...
環境要因とADHD診断 【ADHD血液診断】交差検証等を実施した最終モデル
ADHDにはコンサータおよびインチュニブならびにストラテラ等の有効な治療薬が存在しますが、これらの処方には医師による診断が必要です。現在ADHDの診断はDSM-5という基準に従って実施されていますが、その解釈は医師よって異なり、誤診による不...
環境要因とADHD診断 【ADHD血液診断】ランダムフォレストによる予測モデル
ADHDにはコンサータおよびインチュニブならびにストラテラ等の有効な治療薬が存在しますが、これらの処方には医師による診断が必要です。現在ADHDの診断はDSM-5という基準に従って実施されていますが、その解釈は医師よって異なり、誤診による不...
環境要因とADHD診断 【ADHD血液診断】特徴量を選択してから次元削減
ADHDにはコンサータおよびインチュニブならびにストラテラ等の有効な治療薬が存在しますが、これらの処方には医師による診断が必要です。現在ADHDの診断はDSM-5という基準に従って実施されていますが、その解釈は医師よって異なり、誤診による不...
環境要因とADHD診断 【ADHD血液診断】レプリケートを考慮して次元削減
ADHDにはコンサータおよびインチュニブならびにストラテラ等の有効な治療薬が存在しますが、これらの処方には医師による診断が必要です。現在ADHDの診断はDSM-5という基準に従って実施されていますが、その解釈は医師よって異なり、誤診による不...
環境要因とADHD診断 【ADHD血液診断】次元削減
ADHDにはコンサータおよびインチュニブならびにストラテラ等の有効な治療薬が存在しますが、これらの処方には医師による診断が必要です。現在ADHDの診断はDSM-5という基準に従って実施されていますが、その解釈は医師よって異なり、誤診による不...
環境要因とADHD診断 【ADHD血液診断】データのダウンロードと前処理
ADHDにはコンサータおよびインチュニブならびにストラテラ等の有効な治療薬が存在しますが、これらの処方には医師による診断が必要です。現在ADHDの診断はDSM-5という基準に従って実施されていますが、その解釈は医師よって異なり、誤診による不...
環境要因とADHD診断 【環境要因】血液トランスクリプトームに基づいたADHD診断指標【BRS】
ADHD は近年社会的に非常に注目を集めている発達障害疾患の 1 つであり、有病率も米国では 18 歳以下の 10%近く、我が国でも恐らく 4%ほどあり、極めて頻度が高いことが知られています。不注意・多動・衝動性という 3 つの特性を持ち、...