バイオインフォ基礎

DNAメチル化は、遺伝的情報の一部が化学的に修飾される過程の一つであり、生物の発生、成長、分化や遺伝子の発現制御に重要な役割を果たします。DNAのメチル化とは、主にシトシン（C）の5位炭素（C5）にメチル基（-CH3）が付加されることを言...

次世代シーケンサ(Next Generation Sequencer：NGS)は、一度に大量のDNA配列を決定することができる高出力型のDNA配列決定装置です。これにより、ゲノム全体の塩基配列を短期間で決定すること等が可能となりました。 ...

バイサルファイトシークエンシング（Bisulfite Sequencing）は、DNA内に存在するメチル化シトシン（5mC）を検出するための手法の一つで、DNAのメチル化状態を全ゲノムで同定する実験です。目的はエピジェネティクスの理解です...

Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing (ATAC-seq) は、エピゲノムを理解するための重要な手法です。ATAC-Seqは、クロマチンアクセシビリティ（D...

ChIP-Seq（Chromatin Immunoprecipitation Sequencing）は、染色体上における特定のタンパク質（例えば、DNA結合タンパク質やヒストン修飾結合タンパク質）の結合部位を同定するための手法であり、その...

RNA-Seq（RNA sequencing）とは、トランスクリプトームを高精度で定量することができる革新的な実験です。その手順は、RNAの抽出、mRNAの精製、RNAの逆転写、アダプター付加、PCR増幅、次世代シーケンサーによる配列決定...

DNAマイクロアレイは、厚さ数ミクロンのガラススライド上に数万種類の異なるDNA断片（オリゴヌクレオチド）を固定化した実験機器あるいはその機器を用いた実験の名称です。各DNA断片は固定位置に並んでおり、これに相補的なDNAまたはRNAをマ...

CRISPR/Cas9（Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats/CRISPR associated protein 9）は、細菌や古細菌がウイルスから身を守るため...

ヒストンとは、真核生物のクロマチン内に存在するタンパク質の一種で、その主な役割はDNAの保護と構造の維持です。DNAは非常に長い分子であり、細胞内で適切に機能するためには、適切な形状にまとめられ、管理される必要があります。それを可能にする...

PCR（Polymerase Chain Reaction）は、特定のDNA断片を大量に増幅する技術です。その手法が画期的で、また様々な研究や診断に応用できるため、生命科学の研究においては、重要な実験方法の一つとなっています。 原理...