バイオインフォ基礎

遺伝子のノックインとノックアウトは、生物学において遺伝子機能を研究するための実験手法の一つです。 遺伝子のノックイン 定義 遺伝子のノックインとは、目的とする遺伝子をゲノム上の特定の位置に導入する技術のことを指します。こ...

TALEN(Transcription Activator-Like Effector Nucleases)は、対象とするオリゴヌクレオチド配列に特異的に結合し、その位置でDNAを切断することで遺伝子の機能を変化させるゲノム編集技術の一つ...

ZFN（Zinc Finger Nuclease）は、「ジンクフィンガーヌクレアーゼ」という名のゲノム編集技術の一つです。この技術は、遺伝子工学によって進化したものであり、遺伝子の特定の場所を切断したり、配列を挿入できる能力を有しています...

ユビキチン化とは、ユビキチンという小型のタンパク質が他のタンパク質に結合してその働きや運命あるいは機能を変えることを意味します。これは生体内に広く見られるメカニズムで、タンパク質の分解等を中心に散見されます。 反応機序 ユビキ...

メチル化とは酵素等によるメチル基(-CH3)の添加を指します。この過程では、標的原子や分子にメチル基が追加されます。この用語は、DNAやRNA、タンパク質などの分子に対しても使用されます。 機序 メチル化反応の基本的なメカニズ...

アセチル化とは、アセチル基を他の分子に付加する化学反応のことを指します。以下の化学式で表現されます。 CH3CO2H + R-OH -> CH3CO2R + H2O ここで、CH3CO2Hは酢酸、R-OHはアルコール、C...

ヒストンテールとは、ヒストンタンパク質のアミノ酸配列のN末端側の一部です。ヒストンテールはヌクレオソーム形成に服さない自由な部分で、エピジェネティックな制御の役割を果たします。 修飾 ヒストンテールのアミノ酸残基はアセチル化、...

オープンクロマチンとは、クロマチンが遺伝子発現を可能にするようにほどけた構造を指します。このほどけたクロマチンは、転写因子やRNAポリメラーゼといった分子がDNAと結合しやすくなっており、そのため遺伝子がアクティブに転写されます。反対に、...

5-メチルシトシン（5-methylcytosine、5-mC）はシトシンの5位の炭素原子がメチル基で修飾されたヌクレオシドです。分子式はC5H7N3Oとなります。この修飾はDNAの脱メチル化やメチル化の過程で発生し、そのためにDNAメチ...

Dnmt1(DNA methyltransferase 1)は、哺乳類の5つのDNAメチルトランスフェラーゼ(DNMTs)の一つです。他のDNAメチルトランスフェラーゼとは異なり、Dnmt1は主に半保存的複製中に親鎖から娘鎖へとメチル基を...