環境要因とADHD診断 【ADHD血液診断】次元削減
ADHDにはコンサータおよびインチュニブならびにストラテラ等の有効な治療薬が存在しますが、これらの処方には医師による診断が必要です。現在ADHDの診断はDSM-5という基準に従って実施されていますが、その解釈は医師よって異なり、誤診による...
環境要因とADHD診断 
環境要因とADHD診断 【ADHD血液診断】データのダウンロードと前処理
ADHDにはコンサータおよびインチュニブならびにストラテラ等の有効な治療薬が存在しますが、これらの処方には医師による診断が必要です。現在ADHDの診断はDSM-5という基準に従って実施されていますが、その解釈は医師よって異なり、誤診による...
環境要因とADHD診断 【環境要因】血液トランスクリプトームに基づいたADHD診断指標【BRS】
ADHD は近年社会的に非常に注目を集めている発達障害疾患の 1 つであり、有病率も米国では 18 歳以下の 10%近く、我が国でも恐らく 4%ほどあり、極めて頻度が高いことが知られています。不注意・多動・衝動性という 3 つの特性を持ち...
やってみた 【血圧予測#3】Polar OH1の心拍データをリアルタイムで取得【MacOS】
心拍は血流速度です。従って、その時間変化は本質的に血圧の情報を含んでいます。そこで、2点間の心拍から血圧を予測することに挑戦してみます。
前回までには、心拍計の選定と心拍数を取得するために必要なラズベリーパイの準備の手順を紹介しまし...
備忘録 【MacOS Sequoia 15.1】Node.jsのインストールと実行【bash/zsh】
Node.js®はクロスプラットフォームに対応したフリーでオープンソースのJavaScript実行環境です。開発者にサーバー、ウェブアプリ、コマンドラインツール、スクリプトなどを開発する環境を提供します。
本記事では、MacOSにn...
備忘録 【Python/Pandas】書式設定を制御してExcelに出力【StyleFrame】
本記事では、PythonのライブラリであるpandasからExcelファイルへ出力する際に、セル内改行や行または列の幅などを指定して出力する方法について説明します。
1. StyleFrameの準備
StyleFrameという...
備忘録 【ChEMBL】化合物のIC50/ID50を調べる
本記事では化合物のIC50およびID50をChEMBLから取得する手順を説明します。
IC50は化合物の標的タンパクの半分が活性を阻害される化合物の濃度です。
ID50は細胞や生物の半分が化合物の毒性によって死ぬ化合物の濃度で...
備忘録 【Python】デコレータ【時間計測・Try】
本記事では、Pythonのデコレータ(関数の上の行に付与する@から始まる文言)の使用方法について、関数の時間計測やTry構文を例に説明します。
1. 時間計測
デコレータは@hogeのように宣言された下の行から始まる関数を引数...
備忘録 【Python】化合物名からIUPAC名・InChIKey・CAS番号を取得【pubchempy】
本記事では、alanineのような化合物名からIUPAC名などの他の情報を取得する方法を説明します。
具体的には以下の内容の取得について取り扱います。
synonyms：別名
CID
InChI
InChI...
備忘録 【Python】混合ガウス分布【scikit-learn】
1. 理論
2. 学習
2.1. 基本
モデルを宣言し、fitでデータを当てはめます。
当てはめた後のオブジェクト(gmm)が学習後のモデルです。
means_メソッドやbicメソッド、predict...